Рак: знание эпигенетических маркеров может улучшить терапию

Ученые давно знают, что рак может быть вызван генетическими мутациями, но в последнее время они обнаружили, что химические модификации генов могут также способствовать развитию рака. Эти изменения, известные как эпигенетические модификации, зависят от того, включен ген или выключен.

Анализируя эти изменения, специалисты могут узнать важную информацию о типе опухоли и о том, как пациент будет реагировать на разные виды лекарств. Например, люди с глиобластомой – опухолью головного мозга, хорошо реагируют на алкилирующие агенты, если ДНК-ремонт гена MGMT подавит в нем эпигенетические модификации.

Команда инженеров-химиков разработала быстрый и надежный способ обнаружения этого типа модификации, известного как метилирование, благодаря которому можно выбрать лучшее лечение для отдельных пациентов.

Автор исследования Хэдли Сайкс (Hadley Sikes) пишет: «После секвенирования генома человека, ученые обратились к эпигеному – модификации (в том числе метилированию), которая изменяет функции гена без изменения последовательности ДНК В некоторых видах рака, ген MGMT выключается, когда метильные группы воздействуют в определенных местах последовательности ДНК. Это очень маленькая химическая модификация запускает последовательность событий, из-за которых ген уже не может действовать как прежде».

Современные методы обнаружения последствий реакции трудно использовать в исследованиях, в которых речь идет об одном-двух пациентах.

Большинство методов требует химической реакции, где образец ДНК подвергается воздействию бисульфита, который преобразует неметилированный цитозин, и на основе результатов этого процесса рассчитывается стратегия лечения.

«Нам нужно знать точно, сколько метилированных ДНК есть в образце, чтобы рассчитать, сколько времени можно подвергать его воздействию бисульфита, а образцов слишком мало», – говорит Сайкс.

Новый подход исключает бисульфит полностью. Вместо этого в нем используют метил-связывающий домен белка (MBD), который является частью природного механизма для контроля клеточной транскрипции ДНК. Этот белок распознает метилированную ДНК и связывается с ним, помогая исследователям.

Связывание между ДНК и белком MBD может быть обнаружено либо путем связывания белка с флуоресцентным красителем или благодаря фоточувствительной молекуле, которая образует гидрогель под воздействием света.

Команда ученых теперь занята адаптацией устройства для обнаружения метилирования других раковых генов. Они также надеются создать лучшие версии белка MBD и спроектировать устройство, для которого потребуется меньше образцов ДНК.